作为生态系统的主要分解者。微生物能够分解复杂的有机物质，如动植物残体，将其转化成简单的无机物，这些无机物可供初级生产者利用。

　　参与物质循环。微生物在几乎所有的物质循环中都发挥着关键作用，包括碳、氮、磷、氧、硫、铁和氢等元素的循环。

作为生态系统中的初级生产者。光能营养和化能营养的微生物能够直接利用太阳能或无机物的化学能进行光合作用，从而成为生态系统的能量来源。

　　储存物质和能量。微生物在土壤和水体中积累大量的物质和能量，对生态系统的稳定性和生物多样性具有重要作用。

　　在地球生物演化中扮演重要角色。微生物是最早出现的生物体，它们的活动为后来的生物进化打下了基础。

　　调节气候。土壤微生物通过分解凋落物和异养呼吸等方式参与二氧化碳等温室气体的排放和地球生物化学循环过程，对全球气候变化有显著影响。

　　害虫和疾病控制。微生物可以影响害虫和疾病的发生，例如通过产生抗生素来抑制某些病原体的生长。

　　降解毒素和污染物。某些微生物能够降解环境中的毒素和污染物，从而保护生态系统的健康。