微生态制剂是利用正常微生物或促进微生物生长的物质制成的活菌制剂。也就是说，一切能促进正常微生物群生长繁殖的及抑制致病菌生长繁殖的制剂。 

根据现在微生态制剂的产品特点可以分为两种，一种是单一型微生态制剂，另一种为复合型微生态制剂。

单一型微生态制剂是以单独菌种为主要成分，发挥其生理活性， 这类菌株包括乳酸杆菌、酵母菌、芽孢杆菌等。由于单独菌株作用的独特性，不能完全适合动物体内的复杂变化，复合型微生态制剂在市场中受到广泛关注。

复合型微生态制剂又以成分不同分为复合菌微生态制剂和合生态 微生态制剂—合生元。复合菌微生态制剂可以是两种及两种以上相同种属或不同种属菌株组成，以EM菌露为例，其包括菌株繁多，有光合细菌、乳酸菌、放线菌、酵母菌、发酵型丝状菌等5科10属80多种好氧性和厌氧性微生物组成的多种有益的优良微生物菌群，可应用于保健、水产、养殖、种植甚至环保等方面。

这些微生物组合在一个统一体中互相促进，共同组成一个复杂而稳定的具有多元功能的微生物生态系统。

合生元是由益生菌和益生元组成。益生元是通过选择性的刺激一 种或少数种菌落中的细菌的生长与活性而对寄主产生有益的影响从而改善寄主健康的不可被消化的食品成分，如各种寡糖类物质或称低聚糖。

常见的有乳果糖、蔗糖低聚糖、棉子低聚糖、异麦芽低聚糖、玉米低聚糖、大豆低聚糖和酵母细胞壁等。

这些糖类不能被动物自身及其肠道内的致病菌所消化和吸收，只能为肠道有益菌群如双歧杆菌和乳杆菌等特异性利用，因此可以促进有益菌的生长繁殖，间接地抑制有害菌的生长，从而达到调整肠道正常菌群的目的。

2006年农业部公布的658号公告，明确说明我国允许使用的微生物添加剂包括16种，这些有益微生物分别是地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、两歧双歧杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、乳酸肠球菌、嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌、乳酸乳杆菌、植物乳杆菌、乳酸片球菌、戊糖片球菌、产朊假丝酵母、酿酒酵母、沼泽红假单胞菌、保加利亚乳杆菌。在现阶段常用的菌种有地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、两歧双歧杆菌、粪肠球菌、乳酸肠球菌、嗜酸乳杆菌、乳酸乳杆菌、酿酒酵母。

但由于现代饲料加工工艺、存储条件、菌种作用方式等方面的要求比较严格，在以上菌种中又以地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌最受关注，使用范围也最广泛。

根据2006年农业部公布的658号公告中这些微生物的特性可分为三类，下面做简单介绍。1酵母菌类酵母菌是单细胞真核微生物,具有典型的真核细胞结构,有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质, 在成熟的酵母菌细胞中,有一个大型的液泡,其内含有一些水解酶等物质。酵母菌细胞的形态通常有球形、卵圆形、椭圆形等。酵母菌无鞭毛,不能游动。具有多种水解酶活性，蛋白质含量达50%～60%，并含有丰富的B族维生素。少量存在于动