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光合细菌是一种兼性嫌气细菌，需要深层培养或在真空干燥器内达到嫌气或半嫌气状态，一般将混合菌放入培养液中先富集再分离。具体方法:将混合菌装入 10ml试管中，加入培养液充满至刻度，盖上胶塞，在光照条件下保持在30℃左右培养。待培养液出现红色后，取培养液加1.5%的琼脂，制成固体培养基，取菌液分别用无菌水以10-100000000倍稀释，分别取lml样本涂在平皿上，光照、30℃培养2d左右在平板上长出菌落。移至平板采用划线法进行分离，将划好线的平板倒置，在相同条件下培养，反复分离纯化，挑取不同特征的菌落，用斜面保存，纯化分离后的菌种置于冰箱保存备用。
PSB 培养中除碳、氮、磷等主要营养元素外，还需要一定量的镁、钙、钠和有关的微量元素，将所需的营养元素按一定的比例配成适于菌体生长繁殖的培养基。本实验室采用酵母膏、蛋白胨培养基，基本配方为:CaCl2 0.3g，MgSO4·7H2O 0.5g，酵母膏3g，蛋白胨3g，蒸馏水1000ml，pH: 6.8. 如需制固体培养基再加2%琼脂。培养温度：25℃～30℃最佳，光照强度：2000LX～5000LX，PH：7.5～8.5最佳。
把菌种接种到灭好菌的培养基中，在三角瓶中进行二级培养，每天摇晃几次。把 40L 的反应器中加满自来水，放入通气管，盖上保鲜膜一起用次氯酸杀菌消毒24小时，用硫代硫酸钠（1L次氯酸需要150g硫代硫酸钠）来中和。以15%的接种量接入反应器中，用泵通气培养，用分光光度计跟踪测量菌液的密度，得到菌液的密度较高，而且反应器还可以进一步放大。
细菌生长培养基
NaCOOH3.0g.酵母膏3.0g，NH4CL2.0g，KH2PO4 0.5g，天然海水1000ml，高温灭菌。
100ml具塞容量瓶中装有50ml光合细菌培养基，按10%接种量接种母液（约每毫升10亿个细胞）混合均匀后置于恒温光照培养箱中光照厌氧培养，光强2500Lux，温度30摄氏度。
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